A przecież nawet jeszcze nie skończyliśmy pierwszego sezonu.
Ale przechodząc dalej: statkiem, który udał się do Solum, aby nawiązać Pierwszy Kontakt, był USS Protostar, dowodzony przez kapitana Chakotaya (Robert Beltran). Po Pierwszym Kontakcie, Protostar przeleciał przez tunel czasoprzestrzenny, który przeniósł go 52 lata w przyszłość, gdzie następnie był świadkiem niszczycielskich skutków wojny domowej w Solum. Soothsayer przechwycił Protostar i uzbroił go w Living Construct — wirus, który powoduje, że statki Federacji automatycznie atakują się nawzajem — w nadziei na odesłanie go z powrotem do pierwotnego czasu i zapobieżenie Pierwszemu Kontaktowi. Zamiast tego, Chakotay wysłał statek 52 lata wstecz przez dziurę czasoprzestrzenną i skierował go w losowe miejsce w przestrzeni.
Protostar wylądował w pobliżu kolonii górniczej, w której Dal i jego przyjaciel byli przetrzymywani w niewoli, i tam zaczyna się „Prodigy”. Pierwszy sezon zakończył się tym, że dzieci Protostara przechytrzyły Divinera, odkryły jego plan i wróciły do przestrzeni Federacji.
Chakotay jednak wciąż tkwił w pułapce 52 lat w przyszłości. Na początku drugiego sezonu „Prodigy” prawdziwa Janeway wyrusza na misję ratunkową nowym statkiem, Voyager-A. Dal i spółka są teraz stażystami Floty Gwiezdnej i mogą się do nich przyłączyć. Janeway wyjaśnia publiczności, że dziura czasowa, przez którą przeleciał Chakotay, wciąż znajduje się w tym samym miejscu, ale jest niestabilna i może się wkrótce zawalić. Musi działać szybko.
Ponadto, co jest niezwykłe, czas płynie w tym samym tempie po drugiej stronie tunelu czasoprzestrzennego, więc jeśli godzina mija w teraźniejszości, godzina mija również 52 lata w przyszłości. Chakotay przebywa w więzieniu przyszłości Wróżbity od jakiegoś czasu.
